为了确保您在香港申请的条形码在中国内地合法使用，您需要遵循以下步骤：

备案条件：确保备案企业是香港条码所有者全资控股的下属公司，并对所有备案的产品质量负责。同时，备案产品涉及的全部品牌的所有者应为香港条码持有者，且备案产品应在境内生产并在境内销售。

准备备案资料：您需要准备包括营业执照（副本）复印件（需加盖备案企业公章）、香港商品条码的证书复印件、产品外包装图、品牌注册证明（如有）以及使用境外注册商品条码企业备案表两份。

备案流程：首先，备案企业需发送邮件至中国物品编码的邮箱，获得回复后，登录平台完成用户名注册、设置密码。然后，在线提交备案所需的相关信息和材料。中国物品编码审核备案申请，审核通过后出具《使用境外注册商品条码企业备案通知书》。备案企业凭《备案通知书》在产品上印制使用香港条形码。

备案时间：备案的办理时间一般为20个工作日。

备案有效期：备案有效期视香港商品条码证书的期限而定，到期后如需继续使用，应在备案期限到期前3个月内重新办理备案手续。

合法使用：备案成功后，您可以在产品上合法印制使用香港条形码，并确保所有使用条形码的产品都符合中国内地的相关法律法规。

请注意，备案流程和要求可能会随时间变化，建议您在备案前联系中国物品编码或当地的编码分支机构获取新的备案指南和帮助。同时，确保您的香港条形码在有效期内，并在到期前及时续期以保持合法使用状态。