深圳境外投资备案的办理流程主要包括以下步骤：

一、准备申报材料

企业需要准备一系列申报材料，包括但不限于：

企业营业执照复印件，需在有效期内，且经营范围需包含境外投资相关内容。

公司简介及股权架构图，详细介绍内地公司的主营业务、运营情况、股权结构等。

董事会决议或出资决议，明确投资的相关事项，如投资金额、投资方式、投资目的等，并加盖企业公章。

前期工作落实情况说明，包括尽职调查、可研报告（对投资项目的政治、经济、法律等方面的风险进行评估，了解目标国家或地区的政策环境、市场竞争情况、法律制度等，以便做出明智的投资决策）、投资资金来源情况的说明、投资环境分析评价等。

境外投资备案表，按要求填写并加盖印章及企业法人签字。

投资合同或协议（如有），如并购项目的并购合同等。

目标公司的注册证明、章程及运营计划等。

银行资金证明，金额需大于投资额，证明企业有足够的资金用于境外投资。

企业审计报告，新年度经审计的财务报表，体现净利润、净资产、总资产等情况，且净资产和净利润需大于对外的投资额。

二、提交申报材料并受理

企业需要将准备好的申报材料提交至相关部门进行受理，包括：

发改委申报：向发改部门申请项目，报送项目信息，境内投资人签署各项所需法律文件。待发改部门核准或备案后，发放核准文件或备案通知书。

商委（或商务部门）申报：提交申报材料，申请境外投资备案。商委（或商务部门）核准或备案后，发放《企业境外投资证书》。企业应在收到证书2年内在境外开展投资。

在提交申报材料后，相关部门会对材料进行初步受理和审查。受理时间因地区和部门而异，一般在3-20个工作日不等。

三、审核

在初步受理和审查后，相关部门会对企业的投资项目进行审核。审核内容主要包括：

项目是否符合国家的产业政策、外汇管理要求以及国际贸易规范。

资金来源是否合法合规。

投资项目的风险评估是否充分，风险控制措施是否得当。

审核时间因项目的复杂性、规模和行业类别而异，一般在7-14个工作日不等。

四、出证及外汇登记

审核通过后，企业将收到相关部门颁发的备案通知书或备案回执，包括发改委的《境外投资项目备案通知书》及商务部的《企业境外投资证书》。

在获得上述证书后，企业需要进行外汇登记。外汇登记审核时间一般在7-20个工作日不等。企业需要向外汇管理部门提交相关材料，并接受外汇管理部门的监管。

五、后续管理

在备案完成后，企业需要按计划实施境外投资项目。在项目实施过程中，企业还需要按时向相关部门报告项目进展，特别是在项目涉及资金调拨、资金变动或股权变更时，及时向监管机构报备。

，深圳境外投资备案的办理流程包括准备申报材料、提交申报材料并受理、审核、出证及外汇登记以及后续管理等步骤。企业需要按照流程要求逐步进行，并确保所有材料的真实性和完整性。